校訓往往反映學校的治校理念，是師生共同遵守的行為準則與道德規範。國立陽明交通大學成立後，延續合校前兩校的傳統，保留了原陽明大學與交通大學的校訓，並融合兩校精神，訂立出屬於陽明交大的精神。以下就陽明交通大學、陽明大學、交通大學，介紹其校訓精神。
國立陽明交通大學
承襲兩校原本的校訓，訂出本校精神「付出、務實、團結、照耀」。
- 付出：陽明校訓裡的「仁心仁術」與交大精神「飲水思源」，都具有為社會付出貢獻的核心精神。
- 務實：陽明校訓裡的「真知力行」與交大校訓「崇實篤行」，讓陽明交大人在各個領域都打下堅實基礎。
- 團結：在醫學、半導體等不同的產業裡，陽明交大人都具有團結互助的校友文化，我們相信同行致遠。
- 照耀：陽明名言「Second to none」，交大名言「為世界之光」，我們相信創新的思維為人類開創未來。
國立陽明大學
校訓「真知力行，仁心仁術」，源於王陽明提倡的「知行合一」理念，期勉師生關懷人文、追求卓越，並落實於教學與研究中，營造優良的學術風氣與傳統。
國立交通大學
交大各時期有不同的校訓，從最早1900年代的「求實學，務實業」、1920年代的「精勤求學，敦篤勵志，果毅力行，忠恕任事」，1930年代的「實事求是」，到1974年前校長淩鴻勛為新竹交大手題的「知新致遠，崇實篤行」，都特別強調尚實的精神，彰顯本校教育的特色，也是形塑交大學子人格特質的力量，意義深遠。
