國立陽明交通大學成立於2021年，由國立陽明大學與國立交通大學合校而成。以下就陽明交通大學、陽明大學、交通大學各時期的校徽，介紹其變動情形及圖案所代表的意義。
國立陽明交通大學
陽明大學與交通大學於 2021 年正式合校，當年度因校徽尚未出爐，使得畢業證書上沒有校徽，一度引發話題。後來終於在 2023 年 6 月，透過網路票選、委員會票選，與專家小組討論後，由文化銀行與 IF OFFICE 團隊執行設計，最後通過校務會議正式將校徽設計定案，其設計元素融合了兩校原本的校徽特色。
- 蛇杖：是希臘神話中醫神的標記，象徵醫學。
- 蛇杖上加上翅膀：展翅構成Ｙ字型，代表陽明（Yang-Ming）。
- 齒輪：代表運轉不息，48齒則象徵四通八達。
- 鐵砧與鐵鎚：象徵務實、重視實作的精神。
- 中西書籍：橫書代表中文書，直書代表西文書，象徵學貫中西。
- 鐵鍊：表示學科之間環環相扣，也暗喻陽明交大人心手相連、精誠團結。
- 中文校名題字：由具有醫師身份的孫文《民權初步》、《國民政府建國大綱》的字帖集字。除了代表陽明的醫學背景，孫文的兒子孫科也曾擔任交通大學校長，因此選用孫文集字來紀念兩校的歷史連結。
- 英文校名題字：選用 Albertus，以中世紀科學家和哲學家阿爾伯特大帝的名字命名。
國立陽明交通大學成立於2021年，由國立陽明大學與國立交通大學合校而成。以下就陽明交通大學、陽明大學、交通大學各時期的校徽，介紹其變動情形及圖案所代表的意義。
國立陽明交通大學
1975 國立陽明醫學院
- 雪白底色象徵醫事工作之神聖。
- 梅花象徵醫事工作需有之堅毅精神，而橙色國花代表「光明」。
- 蛇杖是希臘神話中醫神的標記，象徵醫學，並以天藍色表示「忠貞」。
- 蛇杖上加上翅膀，推測是受到美國軍醫體系用的飛蛇杖影響。展翅構成Ｙ字型，代表陽明（Yang-Ming）。
- 採用之金色表現應有之醫生之光，並使校徽金碧輝煌。
- 橙色與天藍色為色彩學上的最佳配色。
1994 國立陽明大學
- 內外圓與文字色彩由金色改為代表天空的藍色。
- 校名題字由具有醫師身份的孫文《民權初步》的字帖集字，取代原本楷體。
國立交通大學
1926 南洋大學
- 該校徽由淩鴻勛校長於 1926 年所公布。
- 鐵砧、鐵錘、中西書籍：表示工程教育理論與實作並重，並且學貫中西。
- 鐵鍊：表示學科之間環環相扣，密不可分，也暗喻交大人團結互助。
- 1896 ：是交大創立年份。
- 盾形：是勉勵交大人勇往直前。
- 齒輪：外框像車輪，有工程與交通的寓意。齒數 60 代表一甲子；而齒輪的運轉不息，寓意交大人自強不息的精神。
1930 交通大學
上海教育出版社，1986。
- 精勤、敦篤、果毅、忠恕：此八字篆文是當時的校訓。
- 齒輪：改為50齒。
1940 交通大學
上海教育出版社，1986。
- 校徽中間的圖案設計改回1926年的鐵砧、鐵錘、鐵鍊、中西書籍及1896字樣。
- 齒輪：改為46齒。
- 中英校名與1930年代一樣，都是交通大學，從此設計元素大致底定。
1958 國立交通大學電子研究所
- 交大在臺復校初期，校徽樣式繁多。因此交大電子研究所所長李熙謀委託校友秦丕基設計統一樣式。
- 與1940年代的版本相似，但西文書背分別多印有ESA三個字母，其中E代表 Engineering（工程），S代表Science（科學），A代表Administration（管理），說明了交大在臺復校初期教育的主要內容。
- 齒輪改為24齒，象徵24小時。24小時為一日，取其日復一日，週而復始，自強不息之意。
1958 國立交通大學電子研究所
- 由校友吳伯楨與盧善棟設計的校徽， 大致上與秦丕基的版本相同，但中文書冊為8本，不同於秦丕基的6本，此版用於交大復校初期之校旗。
2000 國立交通大學
- 最後一版交大校徽出現的年代已不可考，推測為 2000 年代左右。
- 其設計元素與復校初期的版本相似，但齒輪改為 60 齒。